يضم المجلس الاستشاري 14 خبيراً يتولى المجلس رسم السياسة التي تسير عليها الهيئة ويساهم بتسيير وتطوير أعمالها من خلال:
1. وضع خطط وبرامج عمل الهيئة.
2. إبداء المقترحات حول مشروع الإطار الوطني والخطط الإقليمية، وخطط التنمية ذات الأهمية على المستوى الإقليمي.
3. إبداء المقترحات حول تقارير تتبع تنفيذ مشاريع التخطيط الإقليمي.
4. اقتراح السياسات التنموية والاستراتيجيات الوطنية والخطط والبرامج المتعلقة بالتخطيط الإقليمي
5. إعداد الدراسات والأبحاث الخاصة بالتخطيط الإقليمي وتوزيعها على الجهات المعنية.
6. إبداء الرأي بخطط التواصل المجتمعي.